期刊简介
本杂志是全国唯一医院感染管理与控制的专业学术期刊。办刊宗旨在于加强医院感染控制，提高全国医院感染管理水平，在全国医院感染管理、消毒灭菌、抗菌药物使用等工作中起导向作用，在业界公认有以下两个特点：一是高学术水平，注重内容的科学性和创新性；二是普及性，指导医院感染管理、监控，提高全国医院感染监控的整体水平。
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首页>中华医院感染学杂志
- 杂志名称：中华医院感染学杂志
- 主管单位：中国人民解放军总医院
- 主办单位：中华预防医学会 中国人民解放军总医院
- 国际刊号：82-747
- 国内刊号：1005-4529
- 出版周期：半月刊
期刊荣誉：中国精品科技期刊期刊收录：北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 知网收录(中), 哥白尼索引(波兰), 国家图书馆馆藏, CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 剑桥科学文摘, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 上海图书馆馆藏, 维普收录(中), 万方收录(中), CA 化学文摘(美)
基于宏基因二代测序技术检测呼吸道病毒的临床应用
缪青；马玉燕；胡必杰
关键词：二代测序, 病毒, 肺炎, EB病毒, 单纯疱疹病毒, 合并感染
摘要：目的 探讨基于宏基因二代测序技术检测呼吸道病毒的临床应用价值.方法 采用随机扩增法、脱氧核糖核酸纳米球、华大基因公司BGI-500测序平台及BWA算法为基础的比对法等技术进行呼吸道痰液标本病毒核酸提取物的二代测序分析,以痰标本中病毒序列数＞100为入选标准,分析检出病毒的类型、序列数及丰度值等参数.结果 根据入选标准,共收集到9例患者,其中77.78％(7/9)的患者合并存在免疫受损因素,如心外科术后、激素治疗、恶性肿瘤、HIV感染等,分别检测出不同病毒的核酸阳性结果如下:4例爱泼斯坦-巴尔病毒(EBV)、2例单纯疱疹病毒1型(HSV1)、1例巨细胞病毒(CMV)、1例人博卡病毒、1例腺病毒D型,另外,部分标本中合并检出细环病毒、猪内源性病毒E.Pearson相关性分析表明,在各项测序参数中,RPKM参数(每100万个序列每100 bp碱基对,匹配上的序列数)与患者氧分压指标存在线性相关.结论 呼吸道病毒感染多发生在合并免疫抑制因素的宿主,检出病毒类型包括EBV病毒、HSV1病毒、CMV病毒等,且部分患者可同时检出细环病毒、猪内源性病毒E.另外,RPKM可能与肺部病变严重程度有关,提示RPKM可能对于预测肺内病灶严重程度有一定意义.
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