期刊简介
本杂志是全国唯一医院感染管理与控制的专业学术期刊。办刊宗旨在于加强医院感染控制，提高全国医院感染管理水平，在全国医院感染管理、消毒灭菌、抗菌药物使用等工作中起导向作用，在业界公认有以下两个特点：一是高学术水平，注重内容的科学性和创新性；二是普及性，指导医院感染管理、监控，提高全国医院感染监控的整体水平。
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首页>中华医院感染学杂志
- 杂志名称：中华医院感染学杂志
- 主管单位：中国人民解放军总医院
- 主办单位：中华预防医学会 中国人民解放军总医院
- 国际刊号：82-747
- 国内刊号：1005-4529
- 出版周期：半月刊
期刊荣誉：中国精品科技期刊期刊收录：北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 知网收录(中), 哥白尼索引(波兰), 国家图书馆馆藏, CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), 剑桥科学文摘, 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 上海图书馆馆藏, 维普收录(中), 万方收录(中), CA 化学文摘(美)
高通量混合基因测序预测志贺菌属新型耐药基因研究
靳春雷；宋智健；周铁丽；包其郁；李劲松
关键词：志贺菌属, 混合基因, 测序, 新耐药基因预测
摘要：目的 通过高通量测序结合生物信息学分析,预测110株志贺菌属中与耐药基因库序列相似度差异较大的潜在新型耐药基因.方法 110株志贺菌属来源于2006年6月-2011年6月温州地区不同医院腹泻患者粪便标本,采用碱裂解法提取志贺菌属的混合基因DNA,Illumina HiSeq 2000高通量测序;通过基于同源比对核心算法的基因分析,挖掘与已知耐药基因遗传变异较大、相似性较低的潜在新型耐药基因.结果 110株志贺菌属中福氏志贺菌30株、宋氏志贺菌80株,福氏、宋氏志贺菌高通量测序总碱基数分别为4.9和3.5 Gb;志贺菌属高通量测序数据信息挖掘,分别获得潜在的耐药片段宋氏志贺菌255个和福氏志贺菌272个,分布于712条Uni-gene中;GO和COG蛋白功能数据库注释,发现其分子功能绝大多数与转运(21.3％)、催化(25.2％)、结合(25.2％)和转录调控(9.3％),福氏志贺菌denovo组装后预测发现外排泵基因mdt操纵子.结论 研究提出的基于同源比对的核心算法,可以有效地预测与参考耐药基因序列相似性较低的基因,为新型耐药基因的发现提供了思路.
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